Cô bé Kobato bí ẩn có nhiệm vụ phải làm đầy một chiếc bình bằng những "trái tim đau khổ" đã được chữa lành để thực hiện điều ước của mình. Đồng hành cùng cô là chú chó bông Ioryogi cộc cằn. Qua từng chương truyện, Kobato giúp đỡ mọi người xung quanh và dần học được những bài học quý giá về tình yêu, sự hy sinh và lòng nhân ái.